primer6最新版
v6.24大小：129 MB更新：2024/10/17
类别：3D制作类系统：WinAll
分类分类
大小：129 MB更新：2024/10/17
类别：3D制作类系统：WinAll
primer6官方版是用于生物医学领域的引物射击工具，通过这款软件能够快速的查询各种基因序列，对于相关领取的科研和学习人员非常好用，软件使用也十分简单。
1、软件安装完之后，就要开始引物设计了，这就需要知道基因序列。一般用NCBI查找，比如要设计rat的CK18 mRNA检测引物。首先选择Nucleotide，然后在搜索栏输入rat CK18。
2、我们要找mRNA，所以选第：个，点进去后拉到最后的origin就能找到基因序列。
3、把这段序列复制到Primer Premier6进行引物设计。
4、点这里的新建按钮会出现对话框，将上面那段序列复制进去，点Add。
5、然后点这个搜索，出现下面对话框，这里可以选择引物在序列哪些地方设计引物，：般不用更改，也就是引物可以设计在整个序列，当然也可以事先查：下序列有几个区，：般引物会跨两个区。
6、接下来设置退火温度、引物长度、产物长度等，点旁边的“Primer Parameters”。主要更改的也就是产物长度，100到300bp为宜，产物太大，会影响扩增效率。
7、点“Search”后，引物序列就出来啦。
8、光设计出引物还不行，还要进行验证，也是在NCBI上进行。在最下方找到“Primer：BLAST”将Primer Premier6设计的引物复制进去。
-跨物种：扩增来自多个物种的序列。
-致病性检测：将寡核苷酸定位在高度保守的区域中。
-仅扩增等位基因特异性的：组相关序列中的单个成员。
-CR引物设计：设计用于PCR和多重实验的引物对。
-简并：从氨基酸序列开始，反向翻译并自动设计低简并区域的寡核苷酸。
-嵌套/多重检查多个候选寡核苷酸之间的同源性。
-限制性内切酶和基序分析：从数据库中选择800多种酶和200个常见基序。
-ClustalW对齐：执行ClustalW对齐后，使用任何资源（包括EBI）加载对齐序列。
-多序列比对：使用流行的Clustal W算法在桌面上比对序列（仅在Windows版本中可用）。
1、对于那些涉及分子生物学领域的人来说，使用Primer Premier等程序可以使使用PCR引物进行设计和分析变得更加容易。它配备了简洁的界面，可触及所有功能，使您可以像计算机一样快速地执行各种任务。
2、关于系统资源使用的重要说明是必须在此时进行。更准确地说，Primer Premier将对您的PC造成很大的压力。 Java的全面开发与此息息相关。您应确保有足够的可用内存，并且在使用该软件时，其他应用程序不应运行得尽可能多。
3、只要您导入特定的序列文件或打开现有项目，该实用程序就会扫描并显示主窗口中的所有数据，并根据您选择的选项在多个选项卡中对其进行结构化。引物属性，BLAST信息和SNP信息都有相应的选项卡，这些选项卡显示所有详细信息。
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